Силы зла все чаще приходят из далекой галактики. Там затевают козни против землян. Фокс Малдер (Дэвид Духовни) и Дэна Скали (Джиллиэн Андерсон), сотрудники ФБР, убедились в этом, когда им не удалось предотвратить взрыв правительственного здания в Далласе. Сыщикам стало ясно, что они имеют дело не с заурядными террористами. Бомба должна была уничтожить тела людей, погибших от неведомой и неизлечимой болезни. Продолжая расследование, Малдер и Скали узнают о странных опытах над людьми в техасской пустыне, откуда шло распространение загадочного вируса. Оказалось, что он был внедрен много веков назад представителями некой внеземной цивилизации, посетившими нашу планету. Возродившись, вирус превратит землян в рабов… Два агента ФБР вступают в бескомпромиссную борьбу за будущее человечества…