хотя если кто знает как можно склеить 2 mov файла тоже поможет.

Руководства на английском:
MOV -> AVI
http://www.dvdrhelp.com/mov2avi.htm
http://www.divx-digest.com/articles/mov2avi.html
MOV -> MPEG
http://www.dvdrhelp.com/tmpgenc.htm

Используются TMPGEnc (+QTReader.vfp) и RAD Video Tools.
(Можно использовать Vegas Video, если есть такая возможность).