Скачиваешь две программы: Monkey Audio и Exact Audio Copy (EAC).
С помощью первой распаковываешь АРЕ в WAV (один здоровенный файл).
Вторая порежет этот WAV на отдельные треки (Tools->Split WAV by CUE sheet).
Потом можно кодировать в МР3 твоим любимым кодировщиком. Я это делаю CDEx.
То же самое можно сделать и на автомате, если воспользоваться
CDi2MP3. Но установить Monkey Audio все равно придется.