Есть файл видозахвата, звук есть только в одном канале, как сделать чтобы было в обоих. Перекодировал VirtualDub-ом, в два прохода. Подскажите рожалуйста как можно настроить звук и спомощью чего?

В любом звуковом редакторе, положить звук на оба канала. Или выкинуть канал без звука и сделать моно, с одним каналом.

Или это вопрос по видеозахвату ?

Просто я ещё не имел дело со звуковыми редакторами, подскажите какой программой.

Посмотри "Инструментарий".