Звук в avi файле соответствует изображению, при кодировании TMPG-ом в mpg в получаемом файле проблемы со звуком. Можно ли в полученном уже файле mpg подкорректировать звук, чтобы опять не тратить время на перекодировку?

Можно. Отделять звук и править его руками в Вегасе, как написано в статье о рассинхронизации. Затем обратно смикшировать поправленный звук с видео.
Разумеетс, звук перекодировать все равно придется, но это намного быстрее, чем перекодировать полный файл.

Или отрезать звук от AVI, обработать и перекодировать, а затем смикшировать с MPG.