Ну да. С перемешением экзешника я как то упустил. С другой строны это не инсталятор. Видимо надо указать - положите exe куда либо где вам будет удобно
Иконку, даже две: активную и неактивную приму в дар и встрою в плагин
"Сами мы не местные" тьфу не дизайнеры - поэтому с рисованием графики не дружны

Гм, идея на счет применять к не всем окнам - надо ее подумать
проблема в том, что не понятно, к какому окну ie применять заданное.